L’analisi efficiente della citometria a flusso e la condivisione di dati molto complessi non sono necessariamente complicate
Il campo della citometria a flusso è entrato nell’era dell’analisi di dati assistita da machine learning. Il software di analisi della citometria a flusso di Cytobank assicura una visualizzazione esaustiva e l’analisi dei dati di una singola cellula senza necessità di competenze di codice.
Analisi dei dati basata su cloud e assistita da machine learning
La piattaforma Cytobank è una soluzione intuitiva basata su cloud per l’analisi di dati multidimensionali e uno strumento affidabile per la gestione e la condivisione controllata di dati visivi (visual data). Certo, i dataset di citometria a flusso possono essere complessi, analizzarli con Cytobank invece è semplice.
Dimensionality Reduction e algoritmi di clustering per dati biologici complessi
La piattaforma Cytobank offre l’accesso agli strumenti per un flusso di lavoro completo, che comprende trasformazione di dati, compensazione di fluorescenza, identificazione classica della popolazione e gating biassiale, fino a un’analisi esaustiva della popolazione tramite algoritmi basati su machine learning come UMAP, opt-SNE, t-SNE CUDA, viSNE, SPADE, FlowSOM e CITRUS.
Accesso sicuro al cloud e facilità di condivisione per collaborare in tutto il mondo
Condivisione e accesso ai dati in qualunque momento, da qualunque luogo, con qualunque dispositivo che opera sul web. Le funzionalità basate su cloud della piattaforma Cytobank consentono agli scienziati di tutto il mondo di collaborare tra loro e approfondire l’analisi di dataset grandi e complessi. I nostri Application Scientist sono a disposizione per aiutare a ottenere il massimo dai dati. Il nostro team di assistenza offre supporto e formazione personalizzati e persino progetti su misura.
Analisi senza necessità di supervisione e ambiente organizzato per migliorare l’affidabilità dei risultati
Addio ai passaggi manuali incerti, come il gating manuale; dati grezzi e risultati restano connessi e organizzati in un unico posto. L’Experiment Manager aiuta a tenere traccia delle operazioni eseguite sui dati mentre Sample Tags velocizza la creazione di numeri significativi mettendo a confronto le variabili sperimentali presenti nel dataset
Punti di forza della piattaforma Cytobank
Citrus
Un algoritmo in due passate che classifica automaticamente i dati di cellule singole e poi identifica le differenze statisticamente significative tra gruppi di campioni, tenendo conto delle conoscenze pregresse. CITRUS è perfetto per fruire della potenza predittiva statistica dei biomarker.
CLUSTERING SENZA SUPERVISIONE
SPADE o FlowSOM per raggruppare le cellule con fenotipi simili in uno spanning tree minimo facile da interpretare, per un’analisi intuitiva rapida e per la presentazione di grandi dataset multidimensionali.
DIMENSIONALITY REDUCTION
La suite Dimensionality Reduction nel cloud Cytobank consente di scegliere tra quattro algoritmi diversi per creare una vista a due dimensioni di dati multiparametrici. Gli algoritmi a disposizione viSNE, UMAP, tSNE-CUDA e opt-SNE aiutano a identificare rapidamente nei campioni sottoinsiemi biologici interessanti o rari.
La funzione DROP permette di eseguire lo stesso algoritmo su qualsiasi tipo di dati in formato tabulare.
Testimonial: L’opinione di un utente di Cytobank
Ecco come Hervé Luche, PhD, Responsabile scientifico del Modulo di immunofenotipizzazione del Centro di fenomica immunitaria di Marsiglia, Francia, usa Cytobank per facilitare l’analisi multidimensionale di dataset citometrici massivi. Guarda qui la sua testimonianza che offre spunti interessanti:
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Cytobank Premium
Perfetto per singoli utenti e piccoli laboratori.
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Ideale per farmaceutica/biotecnologia e università.
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